杯子蛋糕的尺寸有多種，常見的包括：
直徑為5cm, 高度為3.5cm的紙杯蛋糕，這是比較小巧的紙杯蛋糕尺寸，通常是單人份或者兒童份。直徑小於6cm的紙杯蛋糕多用於兒童生日會、派對等場合。
直徑為6cm, 高度為4.5cm的紙杯蛋糕，這是一般比較常見的紙杯蛋糕尺寸。直徑在6-7cm之間的紙杯蛋糕屬於中等尺寸,適合各種場合使用。
直徑為7.5cm, 高度為5cm的紙杯蛋糕，這種紙杯蛋糕尺寸比較大,適合多人分享食用。直徑在7-8cm之間的紙杯蛋糕多用於聚會、團隊建設等場合。
此外，還有一種紙杯尺寸為6.75.37cm的杯子蛋糕。