查重的主要目的是檢測論文中內容的原創性，包括文字、句子、段落、圖片、表格等，是否與現有的文獻或資料存在重複或相似的情況。查重系統通過比對大量的文獻庫和數據資源，檢測論文的相似度和重複率，判斷是否存在抄襲、重複發表等學術不端行為。
查重軟體能檢測論文中的引用來源是否符合學術規範，並檢查格式問題，如字型、字號、行距等是否符合學術要求。此外，查重軟體還會檢測論文中的圖片和表格，以及語言問題，如語法、拼寫、標點等是否符合學術規範。在檢測過程中，查重系統會關注論文的整體結構、標題、摘要、關鍵字、正文內容、引用內容、圖表和公式等部分。
一些查重系統還能檢測網際網路和線上資源上的相似內容，以及與學術資料庫和期刊文獻的相似性。不同的查重系統可能使用不同的檢測算法和標準，因此檢測結果可能有所差異。