次氯酸的毒性主要取決於其濃度。在適當濃度下，次氯酸是無毒的，甚至可以作為消毒用品使用。然而，在高濃度下，次氯酸可能對人體造成損害。
低濃度次氯酸：當次氯酸的pH值為6-7時，對人體黏膜和皮膚沒有腐蝕作用，釋放的氯氣也較少，不會對人體造成損傷。低濃度的次氯酸具有殺菌消毒作用，能夠有效殺滅細菌、病毒等病原體。
高濃度次氯酸：如果次氯酸的pH值低於6，對人體的黏膜和皮膚有腐蝕作用。高濃度的次氯酸不穩定，在光照下可能分解出大量氯氣，造成氯氣中毒。高濃度次氯酸中毒的患者需要迅速清洗污染皮膚，用淡氨水持續霧化以減少呼吸道損傷。
此外，次氯酸具有刺激性，可能引起皮膚黏膜的刺激，尤其是對眼睛和呼吸道黏膜的刺激更為明顯。長期接觸次氯酸可能會增加患癌症的風險。在高濃度下，次氯酸對人體中樞神經系統有較大的損害，可能引起頭痛、噁心、嘔吐等症狀。
因此，在使用次氯酸消毒液時，應嚴格規範使用，並降低消毒液的濃度。使用後應保持室內空氣流通，以減少對人體的潛在危害。