建造水下建築通常採用的方法包括：
圍堰法。這種方法的核心是隔離水，創造一箇無水的施工區域。工程師們首先選擇合適的位置，然後使用填土堆或鐵板建造圍堰，隔離出空地。接下來，通過高壓水泵將圍堰內的水抽出，形成無水的空白區域。在地下石頭較多或水太深的情況下，會使用分割式圍堰或防水布圍成的圍堰。此外，爲了防止水流再次流入，抽水工作會持續進行。在某些情況下，如建造水壩，會先建造大部分不需要在河道水中進行的建築，然後將河水分流，再進行剩餘部分的建造。
沉降法和漂浮法。沉降法是將水箱注水後沉入海底，適合淺海環境。漂浮法則是將比水重的箱體用固定漂浮物選在水中，適合深海環境。最後，獨立的箱體會被打通，形成一箇整體。
沉箱技術。這種方法通過中空的盒子降低到合適位置進行挖掘，並用混凝土填充底部。沉箱在脫水時可能會因兩側壓力導致水滲透，因此通常需要壓縮空氣進行平衡。
分流法。在建造某些水下建築，如水壩時，會通過兩條不同的流道進行分階段建造，這種方法可以防止海底地震和海沙鬆軟導致的沉降，減少平整地基的成本。
這些方法各有優缺點，適用於不同的水下建築項目。