製作烤箱烤羊肉串的醃製方法有多種，以下是一種常見的醃製方法：
將羊肉切成1至2厘米見方的小塊，去除筋膜。
將切好的羊肉放入容器中，加入適量的花椒水、料酒、鹽、白鬍椒粉、孜然粉、辣椒粉、切好的洋蔥、薑片，以及適量植物油，抓拌均勻後醃製至少1小時，最好放入冰櫃冷藏醃製2至3小時。
醃製好後，將羊肉串在竹籤上，注意肥瘦相間。
在羊肉串表面刷一層植物油，撒上適量的鹽、孜然和辣椒麵。
將羊肉串放入預熱至200℃的烤箱中層，烤制約20至25分鐘，中途需翻面。
最後幾分鐘，再次撒上孜然、辣椒粉等調料，放回烤箱繼續烤制直至羊肉串呈現出金黃色。
這種醃製方法能使羊肉串更加入味，增加風味。根據個人口味，可以適當調整調料的使用量。