孢子是一類單細胞的繁殖結構，在自然界中廣泛存在，形態多樣，常見的形狀包括球形、橢圓形、柱形、瓜子形、梭形和半月形等。它們的大小和形狀取決於產生孢子的生物種類和環境條件。例如，靈芝孢子的形狀基本上是橢圓形，表面光滑而乾淨，顏色則呈現出微黃至棕色的色澤，直徑一般在4~6微米之間。
孢子的表面可能光滑，也可能有小疣或呈褶皺狀、棘狀、毛髮狀、鱗片狀。此外，孢子的顏色也豐富多樣，包括白色、灰色、黃色、橙色、紅色、藍色、綠色等。例如，靈芝孢子的顏色因種類、生長條件和採摘時間而異，常見的顏色有黑色、紅色、褐色、黃色和白色等。
在電子顯微鏡下觀察，孢子的結構可以更加清晰地展現。孢子通常由一層細胞壁包圍，這層壁由於其大小和層次複雜性，使得孢子的形態相對複雜。靈芝孢子還具有一層薄膜覆蓋，被稱為「孢子膜」，這種薄膜可以保護孢子，防止其受到紫外線等外界因素的侵害。