赤潮的形成原因通常包括自然因素和人為因素，具體如下：
自然因素。主要包括高溫、海域的封閉性，這些條件有助於藻類的繁殖。
人為因素。如沿岸地區的過度人口密集和經濟發達導致的工業和生活污水排放，農業生產中的化肥和農藥的大量使用，以及海洋開發和養殖業規模的擴大導致的嚴重污染，這些活動導致海域富營養化，營養鹽類（如氮、磷）和微量元素（如鐵、錳）含量的增加，促進赤潮生物的大量繁殖。
另外，水體富營養化、海水污染、水文氣象條件（如水溫、鹽度、光照）的變化，以及微生物活動導致的低氧或缺氧條件，也可能是赤潮形成的原因。