青木瓜和木瓜之間存在幾個主要的區別：
科屬和產地：
青木瓜屬於番木瓜科-番木瓜屬，是熱帶喬木，原產於東南亞，後傳入中國，主要種植地區包括廣東、海南、廣西、雲南、福建、臺灣等省份。
木瓜則屬於薔薇科-木瓜屬，是溫帶喬木，原產於中國，現在在中國各地如山東、河南、陝西、安徽、江蘇、湖北、四川、浙江、江西、廣東、廣西等省份都有種植。
形態特徵：
青木瓜的果實長圓形，熟時橙黃色；果肉厚，黃色，味甜，未成熟時帶酸味，有清香。
木瓜的果實長橢圓形，長10～15釐米，深黃色，具光澤；果肉木質，味微酸、澀，有芳香。
營養價值：
青木瓜相對於一般的木瓜來講藥用價值更高，含有的木瓜酶美顏功效更強，可以用來加工化妝品、護膚品以及各種食品。成熟後含有木瓜酶素、木瓜蛋白酶、胡蘿蔔素以及多種氨基酸。
一般的木瓜含有的木瓜酶會少一些，營養價值也會低一些。
用途：
青木瓜最主要的用途是食用和藥用，可以直接喫也可以熟食，還可以加工成其他食品。
木瓜則具有欣賞價值，庭院中種植可以用來欣賞，但藥用性比較差，不允許藥用。
食用方法：
青木瓜的木瓜酶含量較高，口感生澀，不宜生食，必須經過烹調後才能食用。
常見的黃木瓜可以直接食用，味道清香、果肉細膩、甜美可口。
綜上所述，青木瓜和木瓜在科屬、產地、形態特徵、營養價值、用途以及食用方法上都有所區別。