選擇魚油時，應注意以下幾個方面：
純度。查看配料表中每粒魚油Omega-3的含量與每粒魚油淨含量的比值，高純度魚油通常含有更高的Omega-3脂肪酸，同時污染物含量更低。
成分。根據個人需求選擇不同類型的魚油，例如，維持心血管健康可選擇EPA含量較高的魚油；增強大腦、眼睛健康則可選擇DHA含量較高的魚油。
新鮮度和包裝。優質的魚油容易氧化變質，因此應選擇不透明高密度PE小瓶包裝，並注意密封避光儲存。
魚源的種類和質量。深海冷水魚類如鱈魚、三文魚、沙丁魚等富含Omega-3脂肪酸，選擇來自這些深海冷水魚的魚油產品。
是否有重金屬和污染物。查看產品是否經過獨立第三方機構的檢測和認證，如USP(美國藥典)或NSF(國家衛生基金會)。
價格與品牌。價格並非衡量魚油品質的唯一標準，但過於便宜的產品可能質量不佳。選擇知名品牌的產品可以在一定程度上降低購買低質量產品的風險。
EPA和DHA的含量。一般天然魚油產品，每1000毫克含DHA120mg，EPA180毫克。每天建議攝入1000毫克的EPA和DHA。
魚油的類型。不同類型的魚油在吸收利用率和穩定性上有所差別，優先選擇TG型或者rTG型的魚油。
顏色和透明度。優質的魚油顏色應該是透明或淡黃色，避免選擇顏色過深的產品。