《CLANNAD》After Story的攻略主要涉及遊戲中的關鍵決策點，以確保玩家能夠順利推進劇情並獲得特定結局。以下是一些重要的攻略建議：
在遊戲開始時，玩家應儘量遵循與動漫劇情一致的路徑，這有助於保持遊戲體驗的一致性。
推進主線時，某些選擇會影響劇情的發展。推薦的主線推進順序是：美佐枝、椋、勝平、杏、風子、渚、幸村、智代、琴美、陽平、有紀寧、After Story、棒球線。
為了進入After Story，玩家必須完成New Game學園篇中除了椋線和業餘棒球線外的所有線路。特別是，智代線必須在美佐枝線之後完成，以避免錯過美佐枝的光玉。
在渚線的5月2日，玩家需要選擇「喜歡」的選項，這是影響遊戲OP出現的關鍵決策點。
在遊戲過程中，玩家會遇到多個保存點，這些保存點的正確使用對於完美通關After Story至關重要。例如，在美佐枝線結束後，玩家應該保存遊戲，以便在需要時回到這個點。
此外，還有一些具體的對話和決策建議，例如在與特定角色的互動中如何選擇言辭，以及在面對特定情境時的反應。遵循這些攻略可以幫助玩家更好地理解和體驗《CLANNAD》After Story的故事。