在《GTA3》中，使用直升機的基本操作包括使用W鍵加速上升（或前進），A鍵左轉，D鍵右轉，配合8鍵進行前俯仰，S鍵減速（或下降），4鍵向左傾斜，6鍵向右傾斜，5鍵進行平飛。
特殊操作有E鍵用於運兵直升機鈎住載具，滑鼠左鍵用於攻擊，長按G鍵可以開關起落架，長按可以進入某些飛機的垂直飛行模式。滑鼠滾輪可以用來切換武器。
降落時，控制好速度，不要按W和8，隨便按其他鍵，然後按S和5鍵可以讓飛機慢慢降落。向前走是W加8，向左拐是WA48，向右拐是WD68。急轉彎是WA48或WD68，甩尾急停是向左A45或向右D56。下降時，可以按S8讓飛機頭朝下快速下降，再點按S5可以更快下降。