申請日本的在留資格認定證明書，通常需要遵循以下步驟：
準備申請材料。包括入學願書、履歷書、修學理由書、畢業證書原件、成績證明、身份證複印件、日語能力證明（如J-TEST考試認定書等）。
提交申請。可以通過日本駐華使館直接申請，或委託在日本的親友、學校或工作單位代理申請。
等待審查。申請材料提交後，由日本法務省或地方入境管理局進行審查。
獲得認定證明書。審查通過後，申請人將獲得在留資格認定證明書。
簽證申請。憑藉在留資格認定證明書，到日本駐華使館或領事館申請簽證。
注意，申請材料的準備應真實、詳細，且具有針對性，不同的學校或項目可能會有不同的具體要求，建議提前與學校或相關機構聯繫確認具體細節。同時，要注意材料的真實性，任何虛假信息都可能導致申請失敗。