預付賬款會計科目用於核算企業因採購貨物、接受勞務或其他原因而按契約規定預付的款項。該科目通常按供貨方的名稱或預付費用的種類設定明細科目。
當企業因購貨而預付款項時，應借記「預付賬款」科目，貸記「銀行存款」科目。當收到所購物資時，根據發票賬單等列明的應計入購入物資成本的金額，借記「物資採購」或「原材料」、「庫存商品」等科目，並按專用發票上註明的增值稅額借記「應交稅金—應交增值稅（進項稅額）」科目，按應付金額貸記「預付賬款」科目。如果需要補付或退回多付的款項，也會通過「預付賬款」科目進行相應的會計處理。
在預付款項情況不多的情況下，企業也可以選擇將預付的款項直接記入「應付賬款」科目的借方，而不設定「預付賬款」科目。如果預付賬款的情況不符合預付賬款的性質，或者因供貨單位破產、撤銷等原因已無望再收到所購貨物，應將原計入預付賬款的金額轉入其他應收款。