菊科植物的花序主要是頭狀花序。
頭狀花序的特點是花軸極度縮短、膨大成扁形，其基部的苞葉密集成總苞。總苞保護花序，有些種類的總苞具有特殊結構，如蠟菊的總苞變成膜質並有鮮艷的色彩來吸引昆蟲，或牛蒡、蒼朮及蒼耳等的總苞變成鈎刺，有助於傳播果實和種子。菊科植物的花序可能單生或多個排列成總狀、聚傘狀、傘房狀或圓錐狀。頭狀花序由許多無柄小花（或僅有一朵花）密集著生於花序軸的頂部，聚成頭狀，外形酷似一朵大花，實由多花（或一朵）組成。
此外，菊科植物的花序中可能包含同形小花（全是舌狀花或筒狀花）或異形小花（緣花為假舌狀花，盤花為筒狀花）。